黑臭是外来有机污染超量排放，内源污染持续释放导致的一种极端现象，是由于水体缺氧，有机物腐败而造成的。城市河流、农村坑塘沟渠出现黑臭现象已成为我国严重的水环境污染问题，因此消除黑臭、提升水体表观、创造怡人的水环境是我们目前亟需解决的水环境问题。
针对于黑臭河道及坑塘沟渠，通过利用微生态系统修复技术，对水体中污染物进行转移、转化及降解，从而使水体得到净化，创造适宜多种生物生息繁衍的环境，重建并恢复水生生态系统。通过调节水体微生态系统，刺激和加速土著微生物迅速繁殖，激发土著微生物的活性，并且调控水体的生物多样性及生态群落结构，对水体内微生态系统进行人为干预引导。从根本上修复水生生态系统，恢复水体自净功能。
